Creada en 1941, como su nombre lo indica su propósito está abocado al cuidado, investigación y preservación de la vida de nuestro espejo lacustre, pero principalmente nace para el cuidado del odontesthes bonariensis (popularmente conocido como pejerrey), este lugar es también llamado piscicultura: se dedica el estudio de los peces.

Cuenta con una sala-escuela que contiene un acuario con peces autóctonos, donde se realizan charlas informativas sobre el medio ambiente y ecosistema de la laguna al público en general y escuelas, a través de esta información buscan crear conciencia sobre la importancia del cuidado y correcto uso de los valiosos recursos naturales. 

Los investigadores que allí trabajan se dedican al estudio del pejerrey, los alevinos de la especie se incuban en el laboratorio principalmente en los meses de septiembre a diciembre  para su posterior siembra en la laguna, (es por esta razón que en esa época rige la veda de pesca en la laguna).

La Estación Hidrobiológica actualmente tiene convenios con JICA, organización de origen japonés que mantiene junto a Chascomús un gran desarrollo de investigaciones sobre el pejerrey y la laguna.